11 августа 2010 года Президент Российской Федерации Д.А. Медведев подписал распоряжение о выходе Российской Федерации из Соглашения об учреждении МНТЦ  и из Протокола о временном применении Соглашения. Согласно распоряжению, Соглашение и Протокол считаются прекратившими действие для Российской Федерации по истечении шести месяцев со дня письменного уведомления других сторон Соглашения.

На официальном сайте МНТЦ (www.istc.ru) сообщается, что в настоящее время Центром проводится оценка ситуации. «Как бы она ни развивалась, несомненно одно: работы в рамках текущих проектов продолжаются и должны продолжаться в соответствии с правовыми обязательствами МНТЦ по отношению к своим партнерам и научно-исследовательским организациям России. Семинары, конференции и прочие мероприятия будут проводиться согласно планам», – говорится в сообщении.

 Центр сыграл значительную роль в сохранении российских научных кадров в 1990-е годы. В последнее время, безусловно, задачи изменились, и МНТЦ тоже начал меняться. Однако теперь этот процесс пойдет без участия Российской Федерации. Хочется надеяться, что будет разработано новое соглашение, которое позволит реализовывать международное сотрудничество в научной сфере с учетом нашей специфики».